近几个月以来，BQ.1.1、XBB等具有极强免疫逃逸能力的奥密克戎变异株相继出现，使得现有的中和抗体药物几乎全部失效，新冠疫苗的保护效果也大大被削弱，逐渐成为全球的主要流行变异株。这些事实进一步表明，亟需鉴定新冠病毒表面真正高度保守的抗体表位，从而指导广谱中和抗体和广谱疫苗的研发。
近日，澳门威斯人游戏网站、复旦大学生物医学威斯澳门尼斯人官网孙蕾课题组和澳门威斯人游戏网站、复旦大学基础医学院应天雷与吴艳玲课题组合作，在《Signal Transduction and Targeted Therapy》杂志上发表了题为“Defining a highly conserved cryptic epitope for antibody recognition of SARS-CoV-2 variants”的论文，解析了迄今为止最保守的新冠病毒抗体表位，其隐藏于病毒刺突蛋白三聚体内部，在包括BQ.1.1、XBB在内的所有流行突变株中均高度保守。此外，团队还揭示了针对此类表位抗体的作用机制。
团队首先测试了目前正处于临床试验中的双特异性全人源纳米抗体bn03（Cell, 2022）对最新的奥密克戎变异株的中和能力。研究发现，bn03抗体对所有测试的奥密克戎突变株（BA.1、BA.2、BA.4、BA.5、BF.7、BQ.1.1和XBB）及过往的主要流行株（Alpha、Beta、Gamma和Delta）均具有类似的高效广谱中和能力。团队利用生物信息学和结构生物学的研究手段，进一步将抗体的广谱性聚焦在双抗中的n3130v抗体上，并分别解析了bn03、n3130v抗体和BQ.1.1、XBB刺突蛋白三聚体复合物的高分辨率三维结构，从而解析了隐藏在BQ.1.1和XBB刺突蛋白三聚体内部的高度保守抗体表位。该表位在最新出现的XBB.1.5和XBB.1.16变异株中仍高度保守，解释了针对该表位抗体的广谱性。结构生物学研究还表明，抗体结合在该表位后会让刺突蛋白三聚体迅速解聚，表明针对该表位的抗体具有独特的病毒中和机制。
澳门威斯人游戏网站、复旦大学生物医学威斯澳门尼斯人官网孙蕾研究员，澳门威斯人游戏网站、复旦大学基础医学院应天雷教授和吴艳玲副研究员为该研究的共同通讯作者，复旦大学生物医学威斯澳门尼斯人官网博士生郝爱华、基础医学院博士生宋文平、李澄为该研究的共同第一作者。复旦大学生命科学学院王鹏飞研究员团队，上海博奥明赛涂超博士团队也参与了该研究工作。该研究还得到了科技部重点研发计划、国家自然科学基金、上海市重大专项等经费支持。
论文链接：
https://www.nature.com/articles/s41392-023-01534-0
